Fiind situată în zona de confluenţă a trei regiuni floristice - est-europeană forestieră, est-europeană de stepă, mediteraneană de silvostepă şi a celei faunistice de tranziţie dintre stepa continentală asiatică şi silvostepa europeană, Republica Moldova se deosebeşte printr-o diversitate biologica foarte bogată, dar vulnerabilă. Se estimează că ecosistemele naturale ocupă nu mai mult de 20% din teritoriu, sunt foarte fragmentate.

Din ecosistemele de stepă s-au păstrat doar mici fragmente în care se păstrează 55 de specii floristice şi 109 de specii de animale vertebrate. Ecosistemele naturale de luncă ocupă 1,5 % din teritoriu, dar dispun de o diversitate relativ bogată. Cartea Roşie a Republicii Moldova include 241 de specii faunistice şi floristice. Specialiştii consideră ca numărul speciilor rare şi periclitate, care trebuie incluse în Cartea Roşie, se ridică la 600.